• AltAnalyze是一个跨平台的实用工具，尤其是设计来使用RNASeq数据，确定预测替代拼接和替代启动的改变。

    后分析，就能够查看如何将这些变化可能影响序列的蛋白质、域组成，并mirna的目标。

    AltAnalyze兼容的任何RNASeq数据(用和/或结)，有几个好得多的拼接的敏感阵列类型(基因1.0,显子1.0、结)以及许多常规阵列的类型(例如，好得多的、单，Agilent). 这一软件需要没有先进知识的生物信息学方案或脚本。

    所有你需要的都是你的结/显子读或微阵列的文件以及一些简单的描述的条件在分析。

  • AltAnalyze है एक पार मंच उपयोगिता विशेष रूप से डिजाइन का उपयोग करने के लिए RNASeq डेटा, पहचान की भविष्यवाणी की वैकल्पिक splicing और वैकल्पिक प्रमोटर परिवर्तन.

    विश्लेषण के बाद, आप में सक्षम हैं देखने के लिए कैसे इन परिवर्तनों को प्रभावित कर सकता प्रोटीन अनुक्रम के साथ, डोमेन संरचना, और microRNA लक्ष्य ।

    AltAnalyze के साथ संगत है किसी भी RNASeq डेटा (एक्सॉनों और/या जंक्शनों), कई Affymetrix splicing संवेदनशील सरणी प्रकार (जीन 1.0, एक्सॉन 1.0, junction) के रूप में अच्छी तरह के रूप में कई पारंपरिक सरणी प्रकार (उदाहरण के लिए, Affymetrix, Illumina, Agilent). इस सॉफ्टवेयर की आवश्यकता है, कोई उन्नत ज्ञान के जैव सूचना विज्ञान कार्यक्रमों या स्क्रिप्टिंग.

    आप सभी की आवश्यकता होगी रहे हैं अपने जंक्शन/एक्सॉन पढ़ने के लिए या माइक्रोएरे फ़ाइलों के साथ-साथ कुछ सरल विवरण के साथ स्थिति है कि आप कर रहे हैं का विश्लेषण.

  • AltAnalyze is a cross-platform utility especially designed to use RNASeq data, identify predicted alternative splicing and alternative promoter changes.

    After the analysis, you are able to view how these changes may affect protein sequence, domain composition, and microRNA targeting.

    AltAnalyze is compatible with any RNASeq data (exons and/or junctions), several Affymetrix splicing sensitive array types (Gene 1.0, Exon 1.0, junction) as well as many conventional array-types (e.g., Affymetrix, Illumina, Agilent). This software requires no advanced knowledge of bioinformatics programs or scripting.

    All you will need are your junction/exon read or microarray files along with some simple descriptions of the conditions that you're analyzing.