• 为了设计的探测和引你的微阵列项目,需要处理大量的序列和避免交叉相同,这需要相当大量的时间没有帮助的一个专门的软件,可以在几分钟。

    阵列设计师是一个应用程序,极大地简化了的探测和引创建过程的单核苷酸多态性检测项目,同时也允许你来进行优化爆炸的搜索,在当地数据库,或通过直接连接到NCBI的。 这些搜索确保信号的真实度,并允许自动避免交叉的同源增加探测器的设计最优化。

    此外,创建了引物的优化用于相同的PCR反应的条件,同时探测器可设计成在更大的数字每顺序,以增加检测精度。 最长的探针可以达到99bp,你还可以创建的引物放大的单核苷酸多态性网站。

    在以包括更多的序列入项目,可以将它们载从一个当地计算机,或连接到一个网上数据库,例如Entrez或dbSNP和检索他们使用的测定标识和加入数字。 此外,支持文件格式,包括库和FASTA扩展,这也可以包含多个序列相同的文件。

    在完成之后进行所需的搜索,可以节省的结果和出口他们的外部文件进行进一步的分析,例如Microsoft Excel或Lotus123. 电子表格的形式可以让你轻松的顺序和排序所需的价值观,以及使用他们在一个单独的数据库或其他专门的软件。

    尽管阵列设计师是一个非常复杂的应用程序旨在经验丰富的科学家正在大规模项目,它不会与一个冗长和详细的手册,介绍如何充分利用的工具。 此外,为您提供了一个快速浏览的介绍和各种教程,可以参考的时候你遇到的困难。

  • डिजाइन करने के क्रम में जांच और प्राइमरों के लिए अपने माइक्रोएरे परियोजनाओं, आप की जरूरत है प्रक्रिया के लिए एक विशाल संख्या के दृश्यों से बचने और पार homologies लेता है, जो समय के एक काफी राशि की मदद के बिना एक विशेष सॉफ्टवेयर का टुकड़ा है कि यह कर सकते हैं कुछ ही मिनटों में.

    सरणी डिजाइनर है कि एक आवेदन बहुत सरल जांच और प्राइमर रचना प्रक्रिया के लिए SNP का पता लगाने परियोजनाओं, जबकि भी आप की अनुमति के प्रदर्शन करने के लिए अनुकूलित विस्फोट खोजों पर स्थानीय डेटाबेस या सीधे जोड़ने के द्वारा करने के लिए एन सी बी आई. इन खोजों सुनिश्चित संकेत निष्ठा और आप की अनुमति के लिए स्वचालित रूप से पार से बचें homologies के लिए वृद्धि की जांच डिजाइन अनुकूलन.

    इसके अलावा, बनाया प्राइमरों अनुकूलित कर रहे हैं के लिए समान पीसीआर प्रतिक्रिया की स्थिति है, जबकि जांच का बनाया जा सकता है अधिक से अधिक संख्या में प्रति अनुक्रम को बढ़ाने के लिए, पता लगाने की सटीकता की. अधिकतम लंबाई की जांच कर सकते हैं तक पहुँचने 99bp और आप भी कर सकते हैं बनाने के लिए प्राइमरों कि बढ़ाना SNP साइटों.

    शामिल करने के क्रम में अधिक दृश्यों में अपनी परियोजनाओं के साथ, आप कर सकते हैं या तो लोड उनमें से एक स्थानीय कंप्यूटर में है, या कनेक्ट करने के लिए एक ऑनलाइन डेटाबेस के रूप में इस तरह Entrez या dbSNP और उन्हें पुनः प्राप्त का उपयोग परख आईडी और परिग्रहण संख्या है. इसके अलावा, समर्थित फ़ाइल स्वरूपों में शामिल हैं GenBank और FASTA एक्सटेंशनों कर सकते हैं, जो भी शामिल कई दृश्यों में एक ही दस्तावेज़ है ।

    के बाद आप किया कर रहे हैं प्रदर्शन वांछित खोज कर सकते हैं, आप परिणामों को बचाने और उन्हें निर्यात करने के लिए एक बाहरी फ़ाइल आगे के विश्लेषण के लिए, इस तरह के रूप में माइक्रोसॉफ्ट एक्सेल या लोटस 123. स्प्रेडशीट फार्म की अनुमति देता है आप आसानी से आदेश और प्रकार वांछित मूल्यों, के रूप में अच्छी तरह के रूप में उन्हें का उपयोग में एक अलग डेटाबेस या अन्य टुकड़े के लिए विशेष सॉफ्टवेयर है ।

    हालांकि सरणी डिजाइनर एक बहुत ही जटिल आवेदन के उद्देश्य से अनुभवी वैज्ञानिकों को काम पर बड़े पैमाने पर परियोजनाओं, यह आता है के साथ एक लंबा और में विस्तार से बताते हैं कि मैनुअल कैसे बनाने के लिए पूरा उपयोग की उपयोगिता है । इसके अलावा, आप प्रदान की जाती हैं के साथ एक त्वरित दौरे प्रस्तुति और विभिन्न ट्यूटोरियल परामर्श कर सकते हैं जब आप कठिनाइयों में चलाते हैं.

  • In order to design probes and primers for your microarray projects, you need to process a massive number of sequences and avoid cross homologies, which takes a considerable amount of time without the help of a specialized piece of software that can do it in a few minutes.

    Array Designer is an application that greatly simplifies the probe and primer creation process for SNP detection projects, while also allowing you to perform optimized BLAST searches on local databases or by connecting directly to the NCBI. These searches ensure the signal fidelity and allow you to automatically avoid cross homologies for increased probe design optimization.

    In addition, the created primers are optimized for identical PCR reaction conditions, while the probes can be designed in greater numbers per sequence, in order to increase the detection accuracy. The maximum length of a probe can reach 99bp and you can also create primers that amplify SNP sites.

    In order to include more sequences into your projects, you can either load them from a local computer, or connect to an online database such as Entrez or dbSNP and retrieve them using assay IDs and accession numbers. Furthermore, the supported file formats include the GenBank and FASTA extensions, which can also contain multiple sequences in the same document.

    After you are done performing the desired searches, you can save the results and export them to an external file for further analysis, such as Microsoft Excel or Lotus 123. The spreadsheet form allows you to easily order and sort the desired values, as well as use them in a separate database or other piece of specialized software.

    Although Array Designer is a very complex application aimed at experienced scientists working on large-scale projects, it does come with a lengthy and in-detail manual that explains how to make full use of the utility. In addition, you are provided with a quick tour presentation and various tutorials you can consult when you run into difficulties.