• CueMol是一个先进的应用程序,其目的是帮助你分子可视化的模型。 它可以部署在Windows,Mac OS X和Linux。

    节目给你的可能性进信息分子的坐标(PDB格式),电子密度(CCP4、中枢神经系统,并MTZ格式),MSMS面的数据,并对其进行防范静潜在地图(OpenDX格式)。

    GUI的外观和感觉有点压倒多数在第一目了然的,因为该程序有一个广泛的定制选择。 你可以找到更多有关该工具的能力,在其官方网站。

    有的支持对于一个多标签的环境,它可以帮助你分析不同的分子模型和它们之间切换。 另外,它可以让你抄和粘贴的对象,在不同的场景。

    CueMol给你的可能性,以撤消或重做你的行动,旋转的对象不同的角度,并设立了一套全面的参数,这是关系到现场,分子结构、选择、对称、密度地图、图,并画。

    动画功能,包括支持简单的旋,摄像机的运动,淡出作用和结构变形的选择。 该计划还附带了几个测量工具,这是专门在执行的计算有关的距离、倾角和扭转。

    此外,还允许播放或停止该动画,激活的循环模式和节省的场景计算机上的文件,因此您可以很容易地进口数据为今后的调整。

    你可以用不同的模式显示,即基本分子的功能(例如球棍模型,CPK模型)、卡通的模式,边缘呈现、溶剂分子排除在外面,电子密度呈现通过GPU色器,并且几何图象(固体或虚线)。

    你被赋予的自由,以激活的各种分子的模块有关的任务,例如分子的叠加,分子键编辑、相互作用分析、蛋白质的辅助结构的工具、溶剂排除创建模式、分子表面切实用工具,以及为静电潜力,以便对其进行防范的。

    所有的一切,CueMol提供了一套先进的功能帮助你分析的生物大分子结构,尤其适用于专业用户使用。 GUI看起来有点恐吓和难以解码,因此可能需要投入额外的时间,在配置过程。

  • CueMol एक उन्नत आवेदन है जिसका उद्देश्य है करने के लिए मदद से आप कल्पना macromolecule मॉडल है । यह तैनात किया जा सकता है पर विंडोज, मैक ओएस एक्स और लिनक्स.

    कार्यक्रम आप संभावना देता है आयात करने के लिए जानकारी से आणविक निर्देशांक (PDB प्रारूप), इलेक्ट्रॉन घनत्व (CCP4, सीएनएस , और MTZ स्वरूपों), बैकअप सतह डेटा, और APBS electrostatic क्षमता का नक्शा (OpenDX प्रारूप).

    जीयूआई लग रहा है और लगता है थोड़ा भारी एक पहली नज़र में, क्योंकि प्रोग्राम के साथ पैक आता है की एक विस्तृत श्रृंखला अनुकूलन विकल्प है । आप पा सकते हैं के बारे में और अधिक उपकरण की क्षमताओं पर अपनी आधिकारिक वेबसाइट पर ।

    वहाँ समर्थन के लिए एक बहु tabbed वातावरण में मदद करता है जो आप का विश्लेषण अलग आणविक मॉडल और उन दोनों के बीच स्विच. इसके अलावा, यह अनुमति देता है आप करने के लिए कॉपी और पेस्ट वस्तुओं भर में अलग अलग दृश्य है.

    CueMol के लिए संभावना देता है पूर्ववत या फिर से करना, आप कार्यों को बारी बारी से करने के लिए वस्तुओं, विभिन्न कोणों और सेट अप की एक व्यापक सूट के मानकों से संबंधित हैं जो दृश्य, अणु संरचना, चयन, समरूपता, घनत्व का नक्शा, देखने के लिए, और एनीमेशन.

    एनीमेशन कार्यों में शामिल हैं के लिए समर्थन सरल स्पिन, कैमरा गति,/बाहर में लुप्त होती प्रभाव, और संरचना morphing विकल्प है । इस कार्यक्रम के साथ बंडल आता है कई माप उपकरण है जो विशेष कर रहे हैं में गणना प्रदर्शन करने के लिए संबंधित दूरी, कोण और मरोड़ ।

    इसके अलावा, आप कर रहे हैं खेलने के लिए अनुमति या बंद एनीमेशन, पाश मोड सक्रिय करें और बचाने के लिए दृश्य के लिए अपने कंप्यूटर पर एक फ़ाइल, तो आप कर सकते हैं आसानी से डेटा आयात भविष्य के समायोजन के लिए.

    आप कर सकते हैं के साथ काम अलग अलग प्रदर्शन मोड, अर्थात् बुनियादी आणविक कार्यों (उदाहरण के लिए गेंद और छड़ी मॉडल, CPK), कार्टून मॉडल, किनारे प्रतिपादन, विलायक शामिल आणविक सतह, इलेक्ट्रॉन घनत्व प्रतिपादन के माध्यम से GPU shader, और ज्यामितीय वस्तु (ठोस या धराशायी लाइनों).

    आप कर रहे हैं को देखते हुए स्वतंत्रता को सक्रिय करने के लिए विभिन्न macromolecule मॉड्यूल से संबंधित कार्यों में, इस तरह के रूप में आणविक superposition, आणविक बांड संपादक, बातचीत का विश्लेषण, प्रोटीन माध्यमिक संरचना उपकरण, सॉल्वेंट-बाहर रखा गया है निर्माण मोड, आणविक सतह काटने की उपयोगिता, के रूप में अच्छी तरह के रूप में electrostatic क्षमता द्वारा APBS.

    सब सब में, CueMol प्रदान करता है एक उन्नत सुविधाओं के सेट की मदद करने के लिए आप का विश्लेषण macromolecular संरचनाओं, और है उपयुक्त के लिए विशेष रूप से व्यावसायिक उपयोगकर्ताओं के लिए । जीयूआई लग रहा है एक सा डराना और डिकोड करने के लिए मुश्किल है, तो हो सकता है आप की जरूरत है निवेश करने के लिए अतिरिक्त समय में विन्यास प्रक्रिया है ।

  • CueMol is an advanced application whose purpose is to help you visualize macromolecule models. It can be deployed on Windows, Mac OS X and Linux.

    The program gives you the possibility to import information from molecular coordinates (PDB format), electron density (CCP4, CNS , and MTZ formats), MSMS surface data, and APBS electrostatic potential map (OpenDX format).

    The GUI looks and feels a bit overwhelming at a first glance because the program comes packed with a wide range of customization options. You can find out more about the tool’s capabilities on its official website.

    There’s support for a multi-tabbed environment which helps you analyze different molecular models and switch between them. Plus, it allows you to copy and paste objects across different scenes.

    CueMol gives you the possibility to undo or redo you actions, rotate objects to different angles, and set up a comprehensive suite of parameters which are related to scene, molecule structure, selection, symmetry, density map, view, and animation.

    Animation functions include support for simple spin, camera motion, fading in/out effects, and structure morphing options. The program comes bundled with several measurement tools which are specialized in performing calculations related to distance, angle and torsion.

    In addition, you are allowed to play or stop the animation, activate the loop mode and save scenes to a file on your computer so you can easily import data for future adjustments.

    You can work with different display modes, namely basic molecular functions (e.g. ball-and-stick model, CPK model), cartoon model, edge rendering, solvent-excluded molecular surface, electron density rendering via GPU shader, and geometric object (solid or dashed lines).

    You are given the freedom to activate various macromolecule module-related tasks, such as molecular superposition, molecular bond editor, interaction analysis, protein secondary structure tool, solvent-excluded creation mode, molecular surface cutting utility, as well as electrostatic potential by APBS.

    All in all, CueMol provides an advanced set of features for helping you analyze macromolecular structures, and is suitable especially for professional users. The GUI looks a bit intimidating and difficult to decode, so you may need to invest extra time in the configuration process.