• PROTTEST(ModelTest的相对)是一个用于选择模型的蛋白进化的最适合一个给定的序列(对准)。 模型,包括经验性的替换矩阵(例如WAG、LG、mtREV,Dayhoff,DCMut的,文VT Blosum62,CpREV,RtREV,MtMam,MtArt,HIVb,并HIVw),表明相对价格的氨基酸的替换,具体改善(+I:不变的网站,+G:率的非均质性之间的网站,+F:观察到的氨基酸的频率)考虑到进化的限制impossed保护的蛋白质结构和功能。 ProtTest使用赤池信息的标准(AIC)和其他统计数据(全印度基督教理事会和委)发现该候选模型最适合的数据。 给ProtTest一个尝试,以充分评估其能力!

  • PROTTEST (ModelTest के सापेक्ष) एक कार्यक्रम के चयन के लिए मॉडल प्रोटीन के विकास है कि सबसे अच्छा फिट बैठता है का एक सेट दिया के दृश्यों (संरेखण). मॉडल शामिल हैं अनुभवजन्य प्रतिस्थापन matrices (इस तरह के रूप में हिलाना, एलजी, mtREV, Dayhoff, DCMut, JTT, VT, Blosum62, CpREV, RtREV, MtMam, MtArt, HIVb, और HIVw) से संकेत मिलता है कि के सापेक्ष दरों एमिनो एसिड प्रतिस्थापन, और विशिष्ट सुधार (+मैं:अचल साइटों, +G: दर विविधता साइटों के बीच, +F: मनाया एमिनो एसिड आवृत्तियों के लिए) के लिए खाते में विकास की कमी impossed द्वारा संरक्षण प्रोटीन की संरचना और समारोह । ProtTest का उपयोग करता है Akaike जानकारी मानदंड (एआईसी) और अन्य आंकड़े (एआईसीसी और बीआईसी) में खोजने के लिए जो उम्मीदवार के मॉडल सबसे अच्छा फिट बैठता है डेटा हाथ में है । दे ProtTest एक कोशिश करने के लिए पूरी तरह से अपनी क्षमताओं का आकलन!

  • PROTTEST (ModelTest's relative) is a program for selecting the model of protein evolution that best fits a given set of sequences (alignment). Models included are empirical substitution matrices (such as WAG, LG, mtREV, Dayhoff, DCMut, JTT, VT, Blosum62, CpREV, RtREV, MtMam, MtArt, HIVb, and HIVw) that indicate relative rates of amino acid replacement, and specific improvements (+I:invariable sites, +G: rate heterogeneity among sites, +F: observed amino acid frequencies) to account for the evolutionary constraints impossed by conservation of protein structure and function. ProtTest uses the Akaike Information Criterion (AIC) and other statistics (AICc and BIC) to find which of the candidate models best fits the data at hand. Give ProtTest a try to fully assess its capabilities!