• 序列矩阵是Java基于软件的应用程序,方便用户友好的环境分析系统的数据矩阵和组装他们与多种基因。 它特征的样品的文件和可以让你的出口顺序,以各种格式。

    前提是你必须Java计算机上,它是没有必要安装任何东西。 你可以简单地放下程序的文件上的任何地方的盘或在一个u盘和直接运行的可执行瓶子上的文件的任何计算机Java。 更重要的是,不同于大多数安装,它不应该做任何改动的窗户注册表。

    GUI是根据一个标准的窗口结构布局,在那里,你可以使用的样本和输入序列从FAS格式的文件,分析列taxons,总长度和数字符集、创建outgroups,并删除任何分类单元。 序列可以按名称、种类称号时,数字符集、或总长度,这取决于你的喜好。

    它可以追踪的距离在所有基因,通过指定一个范围,查看成对距离,出口表作为一个选项分隔的文件,以及出口序列作为TNT或联系。 或者,序列可以分成多个文件针对每一栏,以及保存RAxML分析法朗的。

    没有错误对话突然出现在我们的测试,并对软件工具并没有引起操作系统挂或崩溃。 它没有投入了紧张的总体业绩的机,这要归功于一个事实,即它需要较低的CPU和RAM正常工作。

    另一方面,该接口是一个有点生锈,并选项都不直观,用于为欠缺经验的用户。 尽管如此,可以试验序列矩阵为自己,因为它是免费的使用。

  • अनुक्रम मैट्रिक्स एक जावा-आधारित सॉफ्टवेयर आवेदन की सुविधा है कि एक उपयोगकर्ता के अनुकूल वातावरण का विश्लेषण करने के लिए वंशावली डेटा matrices और उन्हें संयोजन के साथ एकाधिक जीन. यह नमूना फ़ाइलें और निर्यात की सुविधा देता दृश्यों के लिए विभिन्न प्रारूपों ।

    बशर्ते कि आप अपने कंप्यूटर पर जावा, यह आवश्यक नहीं है स्थापित करने के लिए कुछ और. आप कर सकते हैं बस ड्रॉप प्रोग्राम फ़ाइलों पर कहीं भी डिस्क या एक यूएसबी फ्लैश ड्राइव पर और सीधे चलाने के लिए निष्पादन योग्य जार फ़ाइल किसी भी कंप्यूटर पर जावा के साथ. अधिक महत्वपूर्ण बात के विपरीत, सबसे installers के लिए, यह नहीं होना चाहिए किसी भी परिवर्तन करने के लिए Windows रजिस्ट्री है ।

    जीयूआई पर आधारित है एक मानक खिड़की के साथ एक अच्छी तरह से संरचित लेआउट है, जहां आप का उपयोग कर सकते हैं के नमूने आयात और दृश्यों से FAS-स्वरूपित फ़ाइलें, विश्लेषण कॉलम के साथ taxons, कुल लंबाई और संख्या के वर्णसेट का, बना outgroups, और हटाने के किसी भी टैक्सोन. दृश्यों के द्वारा हल किया जा सकता नाम, प्रजातियों विशेषण, संख्या के चरित्र सेट, या कुल लंबाई पर निर्भर करता है, अपनी वरीयताओं को.

    यह संभव है नीचे ट्रैक करने के लिए दूरी में सभी जीन द्वारा निर्दिष्ट एक श्रृंखला, दृश्य जोड़ो दूरी, निर्यात के रूप में मेज पर एक टैब-सीमांकित फ़ाइल के रूप में अच्छी तरह के रूप में निर्यात करने के लिए दृश्यों के रूप में टीएनटी या नेक्सस है । वैकल्पिक रूप से, दृश्यों में विभाजित किया जा सकता एकाधिक फ़ाइलों के लिए प्रत्येक स्तंभ, के रूप में अच्छी तरह के रूप में सहेजा के लिए RAxML विश्लेषण पर CIPRES.

    कोई त्रुटि संवाद popped हमारे परीक्षणों में, और सॉफ्टवेयर उपयोगिता का कारण नहीं था करने के लिए ऑपरेटिंग सिस्टम हैंग या क्रैश हो जाता है । यह नहीं था पर एक दबाव डाल समग्र मशीन के प्रदर्शन, धन्यवाद करने के लिए तथ्य यह है कि यह जरूरत कम CPU और राम के लिए ठीक से काम.

    पर दूसरे हाथ, इंटरफ़ेस एक थोड़ा ज़ंग खाया हुआ है, और विकल्प नहीं कर रहे हैं के लिए सहज ज्ञान युक्त कम अनुभवी उपयोगकर्ताओं के लिए है । फिर भी, आप कर सकते हैं परीक्षण अनुक्रम मैट्रिक्स के लिए अपने आप को, के बाद से यह नि: शुल्क का उपयोग करने के लिए है ।

  • Sequence Matrix is a Java-based software application that facilitates a user-friendly environment for analyzing phylogenetic data matrices and assembling them with multiple genes. It features sample files and lets you export sequences to various formats.

    Provided that you have Java on your computer, it's not necessary to install anything else. You can simply drop the program files anywhere on the disk or on a USB flash drive and directly run the executable Jar file on any computer with Java. More importantly, unlike most installers, it shouldn't make any changes to the Windows registry.

    The GUI is based on a standard window with a well-structured layout, where you can use samples and import sequences from FAS-formatted files, analyze columns with taxons, total lengths and number of charsets, create outgroups, and delete any taxon. Sequences can be sorted by name, species epithet, number of character sets, or total length, depending on your preferences.

    It's possible to track down distances in all genes by specifying a range, view pairwise distances, export the table as a tab-delimited file, as well as to export sequences as TNT or NEXUS. Alternatively, sequences can be split into multiple files for each column, as well as saved for RAxML analysis on CIPRES.

    No error dialogs popped up in our tests, and the software utility didn't cause the operating system to hang or crash. It didn't put a strain on the overall performance of the machine, thanks to the fact that it needed low CPU and RAM to work properly.

    On the other hand, the interface is a bit rusty, and the options are not intuitive for less experienced users. Nevertheless, you can test Sequence Matrix for yourself, since it's free to use.