• Sequencher是Windows实用程序,专为帮助用户操纵DNA测序仪和重叠的。

    布局不是非常直观的和新手可能会花费一些尝试配置的专用参数。

    该应用程序提供用户的可能性,以创建一个新的项目通过组装的DNA算法和创建新序列的片段和模板。

    当涉及到进口文件,可以拖他们直接进入主要的小组,或者使用的复印,并粘贴命令。 此外,它使用户可以插入信息,从各种格式的文件,即ABI,经过时,碳当量排放,SCF,GenBank,EMBL,DDBJ和纯文本文件。

    此外,有几个专门设计的工具帮你修剪数据质量差或矢量的污染,从你的序列。 这种方式,可以减少含糊不清和低信任度的数据。

    Sequencher允许用户删除一个序列或多人,重命名的顺序或重叠群,自动保存的项目在预先设定的时间间隔,以及执行基本的序列编辑操作(例如设定基数字,发现含糊不清,使用的语音验证要检查基地呼叫)。

    此外,您可以设立条件,通过配置的专用算法和参数,选择一个自动会的模式、编辑、移动或删除的基地和序列,插入差距或基地,并创建一个新的序列,从协商一致意见。

    它是可能的分析之间的差异顺序和重叠,并且它被证明是非常有用的,尤其是对单核苷酸多态性分析,检测突变,并克隆检查的选择。

    其他重要的特点值得一提的是允许用户查看和打印一份报告,报告使用的图谱,用于编辑的重叠、创建的限制地图,查找项目通过采用不同过滤器和复制信息的剪贴板或打印。

    最后但并非最不重要的是,该程序能够强调所有含糊不清的基地,突出显示基地,已编辑的,也可以选择的背景的颜色和出口的信息为CSM。

    所有的一切,Sequencher都挤满了可配置的DNA大会的算法,DNA序列编辑工具、和其他的有用功能,为帮助用户分析DNA的序列和重叠在一个专业的方式。

  • Sequencher है एक Windows उपयोगिता विशेष रूप से बनाया गया के लिए उपयोगकर्ताओं की मदद करने में हेरफेर डीएनए sequencers और contigs.

    लेआउट नहीं है, बहुत ही सहज और rookies खर्च कर सकते हैं कुछ की कोशिश कर रहा है विन्यस्त करने के लिए समर्पित मानकों.

    आवेदन उपयोगकर्ताओं की संभावना के लिए एक नई परियोजना बनाने के द्वारा कोडांतरण डीएनए एल्गोरिदम, और बनाने के नए अनुक्रम टुकड़े और टेम्पलेट्स.

    जब यह आता है करने के लिए फ़ाइलें आयात कर सकते हैं, खींचें और ड्रॉप में सीधे उन्हें प्राथमिक पैनल, का उपयोग करें या की प्रतिलिपि बनाएँ और चिपकाएँ आदेशों. इसके अलावा, यह उपयोगकर्ताओं को देता है सम्मिलित करने के लिए संभावना से जानकारी विभिन्न फ़ाइल स्वरूपों, अर्थात् ABI, MegaBase, CEQ, एससीएफ, GenBank, EMBL, DDBJ और सादा पाठ फ़ाइलें ।

    इसके अलावा, वहाँ रहे हैं कई समर्पित करने के लिए डिज़ाइन उपकरणों की मदद से आप ट्रिम खराब गुणवत्ता के डेटा या वेक्टर संदूषण से अपने दृश्यों. इस तरह, आप में कटौती कर सकते हैं अस्पष्टता और कम आत्मविश्वास डेटा.

    Sequencher की अनुमति देता है उपयोगकर्ताओं को दूर करने के लिए एक अनुक्रम या कई लोगों का नाम बदलें, एक अनुक्रम या contig, स्वचालित रूप से बचाने के लिए परियोजनाओं पर पूर्व निर्धारित समय अंतराल, के रूप में अच्छी तरह के रूप में प्रदर्शन बुनियादी अनुक्रम संपादन के संचालन (उदाहरण के लिए सेट आधार संख्या, खोजने के लिए अस्पष्टता का उपयोग करें, आवाज सत्यापन करने के लिए जांच का आधार कॉल).

    इसके अलावा, आप सेट कर सकते हैं स्थिति को विन्यस्त द्वारा समर्पित एल्गोरिदम और मानकों, के लिए चुनते हैं, एक स्वत: विधानसभा मोड, संपादित करें, ले जाने या हटाने के ठिकानों और दृश्यों, सम्मिलित अंतराल या कुर्सियां, और एक नया बनाने के अनुक्रम से एक आम सहमति है ।

    यह संभव है का विश्लेषण करने के लिए मतभेद के बीच के दृश्यों और contigs, और यह साबित किया जा करने के लिए बहुत उपयोगी है के लिए विशेष रूप से एसएनपी विश्लेषण, उत्परिवर्तन का पता लगाने, और क्लोन की जाँच विकल्प ।

    अन्य महत्वपूर्ण सुविधाओं के उल्लेख के लायक उपयोगकर्ताओं को सक्षम करने के लिए देखें और प्रिंट रिपोर्ट का उपयोग करें chromatogram संपादन के लिए contigs बनाने के लिए, प्रतिबंध मैप्स, वस्तुओं को खोजने के द्वारा लागू करने के अलग अलग फिल्टर के हैं, और जानकारी कॉपी क्लिपबोर्ड करने के लिए या इसे मुद्रित ।

    पिछले नहीं बल्कि कम से कम, इस कार्यक्रम में सक्षम है को रेखांकित करने के लिए सभी अस्पष्ट कुर्सियां, उजागर अड्डों है कि संपादित किया गया है, और आप भी एक पृष्ठभूमि रंग चुनें, और निर्यात करने के लिए जानकारी CSM.

    सब सब में, Sequencher के साथ पैक आता है विन्यास डीएनए विधानसभा एल्गोरिदम, डीएनए अनुक्रम संपादन उपकरण, और अन्य उपयोगी सुविधाओं के लिए उपयोगकर्ताओं की मदद करने का विश्लेषण डीएनए दृश्यों और contigs में एक पेशेवर तरीके से.

  • Sequencher is a Windows utility built specifically for helping users manipulate DNA sequencers and contigs.

    The layout is not very intuitive and rookies may spend some trying to configure the dedicated parameters.

    The application gives users the possibility to create a new project by assembling the DNA algorithms, and creating new sequence fragments and templates.

    When it comes to importing files, you can drag and drop them directly into the primary panel, or use the copy and paste commands. Plus, it gives users the possibility to insert information from various file formats, namely ABI, MegaBase, CEQ, SCF, GenBank, EMBL, DDBJ and plain text files.

    Furthermore, there are several dedicated tools designed to help you trim poor quality data or vector contamination from your sequences. This way, you can cut ambiguities and low confidence data.

    Sequencher allows users to remove one sequence or multiple ones, rename a sequence or contig, automatically save the projects at preset time intervals, as well as perform basic sequence editing operations (e.g. set base numbers, find ambiguities, use voice verification to check base calls).

    Plus, you can set up conditions by configuring the dedicated algorithms and parameters, opt for an automatic assembly mode, edit, move, or delete bases and sequences, insert gaps or bases, and create a new sequence from a consensus.

    It is possible to analyse the differences between sequences and contigs, and it proves to be pretty useful especially for SNP analysis, mutation detection, and clone checking options.

    Other important features worth mentioning enable users to view and print a report, use the chromatogram for editing the contigs, create restriction maps, find items by applying different filters, and copy the information to the Clipboard or print it.

    Last but not least, the program is able to underline all ambiguous bases, highlight bases that have been edited, and you can also select a background colour, and export the information to CSM.

    All in all, Sequencher comes packed with configurable DNA assembly algorithms, DNA sequence editing tools, and other useful features for helping users analyse DNA sequences and contigs in a professional way.