• 设计用于经验丰富的用户,Treefinder是一个先进的软件工具旨在帮助创建系统发育的树木从分子序列。 它包含了大量的分析模式和其他有用的工具。

    后一个简短的建立过程中,你看到一个简单明了的窗口,该窗口看起来已经过时,整合一的设计图的分子序列。

    你可以写文字,就像在一个普通的字处理器或载荷从一个外部文件,使用一个搜索和替换的功能,进口的图像以及载和运行TL脚本。 它可以放大和缩小的设计或重新从头开始。

    当涉及到分析的信息,可以提出一个模型,并要求Treefinder要检查基地组成,重建的系统,进行分析引导或参引导测试、验证拓扑结构,并假设,计算西米奇和sitewise率,建立一个共识或距离树,以及校正树。

    几个实用工具是放在你的处置,可以查看数据分区、转换序列数据时,检查的名称兼容,生成开始树木,参加多个序列、样品、报告或树文件合并成一个单一项目,计算样品的统计数据,毫升的距离或sitewise likehoods和模拟序列。 撤消你的行动是可能的,所以你可以修复任何错误。

    没有错误对话突然出现在我们的测试,并对软件应用程序没有挂或崩溃。 其影响在机器的性能是最小的,这要归功于一个事实,即它需要较低的CPU和RAM正常工作。 另一方面,Treefinder直没有更新了一个非常长的时间,这清楚地需要一些接口的改进。 尽管如此,它提供强大的和平易近人的选择产生系统发生树木从分子序列。

  • डिजाइन अनुभवी उपयोगकर्ताओं के लिए, Treefinder एक उन्नत सॉफ्टवेयर उपयोगिता desinged में मदद करने के लिए आप बनाने के लिए वंशावली पेड़ से आणविक दृश्यों. यह बहुत सारे शामिल के विश्लेषण मोड और अन्य उपयोगी उपकरण है ।

    एक संक्षिप्त के बाद सेटअप प्रक्रिया के लिए, आप द्वारा स्वागत कर रहे हैं एक सादा और सरल खिड़की है कि पुराना लग रहा है, जो एकीकृत एक डिजाइन को देखने के लिए आणविक दृश्यों.

    आप पाठ लिख सकते हैं बस की तरह एक साधारण वर्ड प्रोसेसर या इसे लोड करने के लिए एक बाहरी फ़ाइल से का उपयोग करें, एक खोज और की जगह समारोह, आयात छवियों, के रूप में अच्छी तरह के रूप में लोड और चलाने के लिए TL स्क्रिप्ट है । यह संभव है करने के लिए ज़ूम में और बाहर के डिजाइन redraw या यह खरोंच से.

    जब यह आता है का विश्लेषण करने के लिए जानकारी है, तो आप का प्रस्ताव कर सकते हैं एक मॉडल और पूछने Treefinder की जांच करने के लिए आधार संरचना के पुनर्निर्माण फाइलोजेनी, प्रदर्शन एक बूटस्ट्रैप विश्लेषण या पैरामीट्रिक बूटस्ट्रैप परीक्षण सत्यापित करें topologies और hypotheses, गणना SimIC और sitewise दरों का निर्माण, एक आम सहमति या दूरी के पेड़, के रूप में अच्छी तरह के रूप में जांच के पेड़ ।

    कई उपयोगिताओं डाल रहे हैं, अपने निपटान में, आप को सक्षम करने के लिए दृश्य डेटा विभाजन, बदलने अनुक्रम डेटा की जांच, नाम अनुकूलता उत्पन्न, शुरू के पेड़ शामिल होने के लिए, एकाधिक अनुक्रम के साथ, नमूना, रिपोर्ट या पेड़ फ़ाइलों में एक एकल आइटम, गणना नमूना आंकड़ों मिलीलीटर दूरी या sitewise likehoods, और अनुकरण दृश्यों. नाश अपने कार्यों संभव है, तो आप तय कर सकते हैं किसी भी गलतियों.

    कोई त्रुटि संवाद popped हमारे परीक्षणों में, और सॉफ्टवेयर आवेदन नहीं किया था हैंग या क्रैश हो जाता है । पर इसके प्रभाव की मशीन के प्रदर्शन के कम से कम था, धन्यवाद करने के लिए तथ्य यह है कि यह जरूरत कम CPU और राम के लिए ठीक से काम. दूसरे हाथ पर, Treefinder नवीनीकृत नहीं किया गया है के लिए एक बहुत लंबे समय है, और यह स्पष्ट रूप से की जरूरत है कुछ इंटरफ़ेस के सुधार है । फिर भी, यह उद्धार शक्तिशाली और सुलभ विकल्प पैदा करने के लिए वंशावली पेड़ से आणविक दृश्यों.

  • Designed for experienced users, Treefinder is an advanced software utility desinged to help you create phylogenetic trees from molecular sequences. It contains plenty of analysis modes and other useful tools.

    After a brief setup procedure, you are greeted by a plain and simple window that looks outdated, which integrates a design view for the molecular sequences.

    You can write text just like in an ordinary word processor or load it from an external file, use a search and replace function, import images, as well as load and run TL scripts. It's possible to zoom in and out of the design or redraw it from scratch.

    When it comes to analyzing information, you can propose a model and ask Treefinder to check the base composition, reconstruct the phylogeny, perform a bootstrap analysis or parametric bootstrap test, verify topologies and hypotheses, compute SimIC and sitewise rates, build a consensus or distance tree, as well as calibrate the tree.

    Several utilities are put at your disposal, enabling you to view data partitions, transform sequence data, check the name compatibility, generate start trees, join multiple sequence, sample, report or tree files into a single item, compute sample statistics, ML distances or sitewise likehoods, and simulate sequences. Undoing your actions is possible, so you can fix any mistakes.

    No error dialogs popped up in our tests, and the software application didn't hang or crash. Its impact on the machine's performance was minimal, thanks to the fact that it needed low CPU and RAM to work properly. On the other hand, Treefinder hasn't been updated for a very long time, and it clearly needs some interface improvements. Nevertheless, it delivers powerful and approachable options for generating phylogenetic trees from molecular sequences.