• 3DiCSI是一个先进的Windows的应用程序开发对于帮助你的审查和解释化学品转变成像(CSI)的数据。 它能够处理各种多尺度的数据集,如1D、2D单一的/多片,3D CSI。

    该工具适用于不同的图像类型,即Philips(PAR/REC),GE Genesis(预11),GE激发11.0或之后(物)、西门子(MAG文件)标准的物文件,布鲁克(2dseq文件)。 此外,你被允许进口任何未知数据种类,通过手工输入的专用参数,并延长该列表的文件格式的援助的第三方的插件。

    你可以检查出CSI的数据和参考图像解剖在同一窗口,而每素可以预览中的一个独立小组与其空间位置显示在三个正交图像窗。

    3DiCSI提供支持的明智处理工具,使你能够操纵的数据设置,所以它可以分阶段、零填充,空间地平滑,过滤,以及基线纠正。 所作的调整应用在现实的时间。 最重要的公用事业值得提及的是专门在不断阶段和线性阶段的修正,临时过滤(Lorentzian,高斯,或者结合)、空间平滑(海明,余弦,费米)的基准修正,水抑制、PPM来源调整和零填充,脂质抑制,并峰值取向。

    批行动可以采用记录的处理顺序的步骤宏文件以后可以在使用上CSI的数据集。 此外,您可以申请宏行动的一系列的考试,在一批模式。

    项目的报告可以出口为HTML文件格式,包括信息有关的图像、光谱、代谢地图和其他相对应的参数。 此外,您可以打印数据并保存一个项目,以计算机上的文件,因此您可以进它的未来。

    3DiCSI让你使用的各种分析方法,例如主要成分分析(PCA),为用户定义的光谱区域和投资回报率为了检测主要组成部分(个人电脑)的变化来源包含在CSI的数据集,常设仲裁法院基础的迭代的高峰期调整过程摆脱频率和相位变化,以及限制非消极的矩阵分解(cNMF)的方法恢复光谱模式和他们的空间分布。

    所有的一切,3DiCSI都挤满了一套全面的特征,范围从数据可视化、光谱处理、光谱化和估计,以及光谱了定量分析程序,例如主要成分分析(PCA)和约束不负矩阵分解(cNMF). 先进的软件包的功能,使得它尤其适用于专业用户使用。

  • 3DiCSI एक उन्नत Windows अनुप्रयोग विकसित की मदद करने के लिए आप की जांच करने और व्याख्या रासायनिक बदलाव इमेजिंग (सीएसआई) डेटा. यह प्रोसेस करने में सक्षम है विभिन्न बहु-आयाम डेटा सेट की तरह, 1D, 2D/एकल मल्टी टुकड़ा है, और 3 डी सीएसआई है ।

    उपकरण के साथ काम करता है अलग छवि प्रकार, अर्थात् फिलिप्स (PAR/आरईसी), जीई उत्पत्ति (पूर्व 11), जीई उत्तेजित 11.0 या बाद में (DICOM), सीमेंस (MAG फ़ाइल), मानक DICOM फाइल, और Bruker (2dseq फ़ाइल). इसके अलावा, आप की अनुमति आयात करने के लिए किसी भी अज्ञात डेटा के प्रकार के द्वारा मैन्युअल रूप से दर्ज समर्पित मानकों, और विस्तार की सूची के साथ फ़ाइल प्रारूपों की सहायता के साथ तीसरी पार्टी plugins.

    आप कर सकते हैं बाहर की जाँच करें सीएसआई डेटा और शारीरिक संदर्भ छवियों में एक ही खिड़की है, जबकि प्रत्येक voxel पूर्वावलोकन किया जा सकता है में एक अलग पैनल के साथ अपने स्थानिक स्थान में प्रदर्शित तीन orthogonal छवि खिड़कियां.

    3DiCSI प्रदान करता है समर्थन के लिए स्मार्ट प्रसंस्करण के उपकरण सक्षम है, जो आप में हेरफेर करने के लिए डेटा सेट कर सकते हैं तो यह चरणबद्ध किया, शून्य से भरा, स्थानिक smoothed, फ़िल्टर, और आधारभूत-सही । समायोजन लागू कर रहे हैं वास्तविक समय में. सबसे महत्वपूर्ण उपयोगिताओं के लायक उल्लेख किया जा रहा में विशेष कर रहे हैं निरंतर चरण और रैखिक चरण सुधार, अस्थायी फ़िल्टरिंग (Lorentzian, गाऊसी, या संयुक्त), स्थानिक चौरसाई (हैमिंग, कोसाइन, फर्मी), आधारभूत सुधार, पानी दमन, पीपीएम मूल समायोजन और शून्य को भरने, लिपिड दमन, और शिखर संरेखण.

    बैच कार्यों में नियोजित किया जा सकता है रिकॉर्डिंग के लिए अनुक्रम के प्रसंस्करण कदम के लिए मैक्रो फ़ाइलें जो हो सकता है पर बाद में इस्तेमाल किया पर सीएसआई डेटा सेट. इसके अलावा, आप आवेदन कर सकते मैक्रो कार्यों की एक श्रृंखला के लिए परीक्षा एक बैच मोड में है ।

    परियोजना रिपोर्ट निर्यात किया जा सकता करने के लिए HTML फ़ाइल स्वरूप और के बारे में जानकारी शामिल छवि, स्पेक्ट्रा, चयापचय के नक्शे, और अन्य संबंधित मानकों । इसके अलावा, आप कर सकते हैं प्रिंट डेटा और एक परियोजना को बचाने के लिए एक फ़ाइल आपके कंप्यूटर में है, तो आप इसे आयात कर सकते हैं भविष्य में.

    3DiCSI की सुविधा देता है आप का उपयोग कर विभिन्न विश्लेषण के तरीकों, इस तरह के रूप में प्रमुख घटक विश्लेषण (पीसीए) के लिए उपयोगकर्ता-परिभाषित वर्णक्रमीय क्षेत्र और लागत पर लाभ के क्रम में पता लगाने के लिए प्रमुख घटक (पीसी) के लिए परिवर्तन के स्रोतों में निहित सीएसआई डेटा सेट, पीसीए-आधारित चलने का शिखर संरेखित प्रक्रिया से छुटकारा पाने के लिए आवृत्ति और चरण बदलाव, के रूप में अच्छी तरह के रूप में विवश गैर नकारात्मक मैट्रिक्स गुणन (cNMF) विधि करने के लिए स्वस्थ हो जाना वर्णक्रमीय पैटर्न और उनके स्थानिक वितरण.

    सब सब में, 3DiCSI के साथ पैक आता है एक व्यापक सूट है कि सुविधाओं की श्रृंखला से डेटा दृश्य, वर्णक्रमीय प्रसंस्करण, वर्णक्रमीय स्थानीयकरण और आकलन, और वर्णक्रमीय मात्रा का ठहराव के लिए विश्लेषणात्मक प्रक्रियाओं, इस तरह के रूप में प्रमुख घटक विश्लेषण (पीसीए) और विवश गैर नकारात्मक मैट्रिक्स गुणन (cNMF). उन्नत पैकेज के कार्यों के लिए यह उपयुक्त बनाता है के लिए विशेष रूप से व्यावसायिक उपयोगकर्ताओं के लिए ।

  • 3DiCSI is an advanced Windows application developed for helping you examine and interpret Chemical Shift Imaging (CSI) data. It is able to process various multi-dimension data sets, like 1D, 2D single/multi slice, and 3D CSI.

    The tool works with different image types, namely Philips (PAR/REC), GE Genesis (pre 11), GE Excite 11.0 or later (DICOM), Siemens (MAG file), Standard DICOM file, and Bruker (2dseq file). In addition, you are allowed to import any unknown data type by manually entering the dedicated parameters, and extend the list with file formats with the aid of third-party plugins.

    You can check out CSI data and anatomic reference images in the same window, while each voxel can be previewed in a separate panel with its spatial location displayed in three orthogonal image windows.

    3DiCSI offers support for smart processing tools which enable you to manipulate data set so it can be phased, zero-filled, spatially smoothed, filtered, and baseline-corrected. The adjustments are applied in real time. The most important utilities worth being mentioned are specialized in constant phase and linear phase correction, temporal filtering (Lorentzian, Gaussian, or combined), spatial smoothing (Hamming, Cosine, Fermi), baseline correction, water suppression, PPM origin adjustment and zero filling, lipid suppression, and peak alignment.

    Batch actions can be employed for recording the sequence of processing steps to macro files which can be later on used on CSI data set. Plus, you may apply macro actions to a series of exams in a batch mode.

    Project reports can be exported to HTML file format and include information about the image, spectra, metabolic map, and other corresponding parameters. In addition, you may print data and save a project to a file on your computer so you can import it in the future.

    3DiCSI lets you make use of various analysis methods, such as Principal Component Analysis (PCA) for user-defined spectral region and ROI in order to detect Principal Components (PCs) for the variation sources contained in the CSI data set, PCA-based iterative peak align procedure to get rid of frequency and phase variations, as well as Constrained Non-Negative Matrix Factorization (cNMF) method to recuperate spectral patterns and their spatial distributions.

    All in all, 3DiCSI comes packed with a comprehensive suite of features that range from data visualization, spectral processing, spectral localization and estimation, and spectral quantification up to analytical procedures, such as Principal Component Analysis (PCA) and constrained Non-negative Matrix Factorization (cNMF). The advanced package of functions makes it suitable especially for professional users.