• 扫是一个方便、易于使用的应用程序专门设计,使大规模分析的单元型的结构中基因组的主要目的检测证据的自然选择。

    首先,它使用长期单倍(度假胜地)试看的等位基因频率高的长范围内联系不平衡(LD),其中建议的单倍迅速上升到高频率之前,重组可能打破协会与附近的标记(自然419(6909):832-7).

    这一软件需要分阶段基因型数据作为投入,检测到的所有单倍块中的数据,然后确定的频率和长期范围内LD对每个基因在每个区块。

  • झाडू है एक आसान, आसान करने के लिए उपयोग आवेदन विशेष रूप से डिज़ाइन किया गया सक्षम करने के लिए बड़े पैमाने पर विश्लेषण के haplotype संरचना में जीनोम के प्राथमिक उद्देश्य के लिए का पता लगाने के प्राकृतिक चयन के सबूत.

    मुख्य रूप से, यह का उपयोग करता है लंबी दूरी के Haplotype (LRH) का परीक्षण करने के लिए देखने के लिए alleles के उच्च आवृत्ति के साथ लंबी दूरी लिंकेज असंतुलन (LD), जो सुझाव के haplotype में तेजी से गुलाब करने के लिए उच्च आवृत्ति से पहले पुनर्संयोजन नीचे तोड़ सकता संघों के साथ आस-पास के मार्कर (प्रकृति 419(6909): 832-7).

    इस सॉफ्टवेयर लेता है चरणबद्ध जीनोटाइप डेटा इनपुट के रूप में का पता लगाता है सभी haplotype ब्लॉक में है कि डेटा, और फिर आवृत्ति निर्धारित करता है और लंबे समय-सीमा LD के लिए प्रत्येक एलील प्रत्येक ब्लॉक में है ।

  • Sweep is a handy, easy to use application specially designed to enable large-scale analysis of haplotype structure in genomes for the primary purpose of detecting evidence of natural selection.

    Primarily, it uses the Long Range Haplotype (LRH) test to look for alleles of high frequency with long-range linkage disequilibrium (LD), which suggest the haplotype rapidly rose to high frequency before recombination could break down associations with nearby markers (Nature 419(6909): 832-7).

    This software takes phased genotype data as input, detects all haplotype blocks in that data, and then determines the frequency and long-range LD for each allele in each block.