• 单体型分析是设计用分子遗传测试,以鉴定DNA片段,分享相似之处。 Haploview已经建立,以提高任务有关此种分析。

    该应用程序是基于Java,这使得它的跨平台并没有必要通过安装过程。

    看起来是简单的一点,与一个小组,接受载于五份文件的格式:标准的联系、数据转储HapMap计划,相或砰砰的。 此外,还支持加载多个文件的通过应用的"批量"的命令行。

    无论选择格式的文件加载应用的相同参数,可以自定义。 这些参考成对比较的标记,这可以是上述一个用户指定的数值(默认设定为500KB).

    第二个参数指数额的基因型失踪个人。 根据用户定价值,这些人可以从分析中排除。

    额外的配置,设置可用于某些支持文件格式。 在这种情况下的标准联系的用户有可能使关的测试、家庭三人数据或负荷测试文件。

    后载入这样的文件有各种显示器提供,其中包括LD的情节,单倍,检查的标记或标记(两两相结合的方法与潜在的效率的multimarker办法的)。

    与格式相HapMap信息轨道可以下载,如果有一个互联网连接。

    该程序可以用于运行LD和分析单倍,以及估计的单倍频率在人口。 本列表的职能还支持排列测试,可能揭示出关联性的意义。

    Haploview是一个程序与科学应用程序支持若干有关的任务的过程中单倍行分析。 它可以用通过学生熟悉的主题,它也是灵活的功能和可用性。

  • Haplotype विश्लेषण के लिए बनाया गया है आणविक आनुवंशिक परीक्षण की पहचान करने के लिए डीएनए खंडों का हिस्सा है कि समानताएं हैं । Haploview बनाया गया है, में सुधार करने के लिए कार्यों से संबंधित करने के लिए इस तरह के विश्लेषण ।

    आवेदन जावा आधारित है, जो बनाता है यह पार मंच और वहाँ है कोई जरूरत के लिए जा रहा है के माध्यम से एक की स्थापना की प्रक्रिया है ।

    लग रहा है, सरल कर रहे हैं और बात करने के लिए, के साथ एक पैनल को स्वीकार करता है कि लोड हो रहा है अप करने के लिए पांच फ़ाइल स्वरूपों: मानक उठाना, डेटा उदासीनता से HapMap परियोजना, चरण या PLINK. वहाँ भी समर्थन लोड हो रहा है एकाधिक फ़ाइलों को लागू करने के द्वारा "बैच" कमांड लाइन.

    की परवाह किए बिना चुना फ़ाइल प्रारूप में भरा हुआ आवेदन एक ही पैरामीटर अनुकूलित किया जा सकता है । इन का उल्लेख करने के जोड़ो में तुलना के मार्कर हो सकता है, जो ऊपर एक उपयोगकर्ता द्वारा निर्दिष्ट मान (डिफ़ॉल्ट सेट करने के लिए 500 KB) है ।

    एक दूसरा पैरामीटर की राशि को संदर्भित करता जीनोटाइप में लापता व्यक्तियों. के आधार पर उपयोगकर्ता-निर्धारित मूल्य, इन व्यक्तियों से बाहर रखा जा सकता का विश्लेषण.

    अतिरिक्त विन्यास सेटिंग्स के लिए उपलब्ध हैं कुछ फ़ाइल स्वरूपों का समर्थन है । के मामले में मानक उठाना उपयोगकर्ताओं की संभावना है करने के लिए सक्षम एसोसिएशन परीक्षण, परिवार के तीनों डेटा या एक परीक्षण फ़ाइल है ।

    लोड करने के बाद, इस तरह के एक फ़ाइल वहाँ विभिन्न प्रदर्शित करता है उपलब्ध है, जो शामिल LD साजिश, haplotypes, जाँच मार्करों या लोहे की पतली पट्टी (जोड़ो को जोड़ती है तरीकों के साथ संभावित दक्षता के multimarker दृष्टिकोण).

    चरण प्रारूप HapMap जानकारी ट्रैक कर सकते हैं डाउनलोड किया जा सकता है, अगर वहाँ एक इंटरनेट कनेक्शन है ।

    इस कार्यक्रम के लिए इस्तेमाल किया जा सकता चल रहा है एलडी और haplotype विश्लेषण के रूप में अच्छी तरह के रूप में अनुमान के haplotype आवृत्ति में जनसंख्या. कार्यों की सूची भी समर्थन करता है क्रमचय परीक्षण कर सकता है कि पता चलता एसोसिएशन महत्व है ।

    Haploview है एक कार्यक्रम के साथ वैज्ञानिक अनुप्रयोगों का समर्थन करता है कि कई कार्यों से संबंधित प्रक्रिया के haplotype विश्लेषण. यह द्वारा इस्तेमाल किया जा सकता छात्रों के साथ परिचित विषय है और यह भी के मामले में लचीला कार्यक्षमता और प्रयोज्य.

  • Haplotype analysis is designed for molecular genetic testing in order to identify DNA segments that share similarities. Haploview has been created to improve the tasks relating to such analysis.

    The application is Java-based, which makes it cross-platform and there is no need for going through an installation process.

    Looks are simple and to the point, with a single panel that accepts the loading of up to five file formats: standard linkage, data dumps from HapMap Project, PHASE or PLINK. There is also support loading multiple files by applying the “-batch” command line.

    Regardless of the chosen file format loaded in the application the same parameters can be customized. These refer to the pairwise comparison of markers, which can be above a user specified value (the default is set to 500KB).

    A second parameter refers to the amount of genotypes missing in individuals. Depending on the user-set value, these individuals can be excluded from the analysis.

    Additional configuration settings are available for some of the supported file formats. In the case of standard linkage users have the possibility to enable association testing, family trio data or load up a test file.

    After loading such a file there are various displays available, which include LD plot, haplotypes, check markers or tagger (combines pairwise methods with the potential efficiency of multimarker approaches).

    With PHASE format the HapMap info track can be downloaded if there is an Internet connection.

    The program can be used for running LD and haplotype analysis as well as estimate the haplotype frequency in population. The list of functions also supports permutation testing that could reveal association significance.

    Haploview is a program with scientific applications that supports several tasks relating to the process of haplotype analysis. It can be used by students familiar with the subject and it is also flexible in terms of functionality and usability.