• 如果你是在寻找一个软件工具,可以帮助你安排大量短的DNA序列,为大的基因组,蝴蝶结的至少值得一试。

    什么样的场景在哪些领结,证明了其相关性在市场上有共同的产品的应对能力时处理集的短读其中至少一个有效的准是包括在大多数的读;当的读取高质量;以及当有少数对报告的读取。

    该工具的低存储器中的足迹可以解释的事实,依赖在洞穴-惠勒索引,以处理基因组,可采用多种处理器,同时为了得到增强准速度。

    必须指出的是,在正常情况下,速度是能够对准35-碱基对中读到人类基因组是25万读每小时,lcolorspace,间隙和配对结束对准模式。

    除此之外,你应该知道,SAM是其中支持的文件格式领结,这意味着事实上的软件工具可以开展的任务需要协同努力与现相一致,比的呼叫者,并SNP。

    值得一提的是蝴蝶结是一种软件的用户可以与通过命令行,所以,有些技术技能是必需的。

  • यदि आप कर रहे हैं तलाश के लिए एक सॉफ्टवेयर उपयोगिता है कि आप की सहायता कर सकता में एक सीध में लाना के बड़े सेट कम डीएनए दृश्यों के लिए बड़े जीनोम, Bowtie है कम से कम एक कोशिश के काबिल है ।

    क्या परिदृश्यों में जो Bowtie साबित होता है, इसकी प्रासंगिकता पर बाजार में आम है उत्पाद की जवाबदेही से निपटने के लिए जब सेट के कम पढ़ता है, जहां कम से कम एक वैध संरेखण शामिल है के अधिकांश में पढ़ता है; जब पढ़ता उच्च गुणवत्ता के हैं; के रूप में अच्छी तरह के रूप में वहाँ है जब एक छोटी संख्या के संरेखण द्वारा रिपोर्ट पढ़ता है ।

    उपकरण की कम स्मृति पदचिह्न द्वारा समझाया जा सकता है तथ्य यह है कि यह निर्भर करता है पर एक बिल-व्हीलर सूचकांक संभाल करने के लिए जीनोम की संभावना के साथ, रोजगार से अधिक प्रोसेसर एक ही समय में प्राप्त करने के क्रम में बढ़ाया संरेखण की गति ।

    यह होना चाहिए उल्लेखनीय है कि, सामान्य परिस्थितियों में, जिस दर पर यह करने में सक्षम है aligning 35-बेस जोड़ी पढ़ता मानव जीनोम के लिए 25 लाख है पढ़ता है, प्रति घंटे के साथ lcolorspace, gapped, और बनती-अंत संरेखण मोड समर्थित किया जा रहा है ।

    इसके अलावा, आपको पता होना चाहिए कि सैम के बीच है फ़ाइल स्वरूप द्वारा समर्थित Bowtie, जो अनुवाद करने के लिए तथ्य यह है कि सॉफ्टवेयर उपयोगिता कर सकते हैं बाहर ले जाने की आवश्यकता के कार्य की सहयोगात्मक प्रयासों के साथ SAMtools आम सहमति, indel कॉल करने, और SNP.

    यह उल्लेख के लायक है कि Bowtie सॉफ्टवेयर का एक टुकड़ा है, उपयोगकर्ताओं कर सकते हैं के साथ बातचीत के माध्यम से कमांड लाइन, तो कुछ तकनीकी कौशल की आवश्यकता होती है ।

  • If you are on the lookout for a software utility that could assist you in aligning large sets of short DNA sequences to large genomes, Bowtie is at least worth a try.

    What the scenarios in which Bowtie proves its relevance on the market have in common is the product’s responsiveness when handling sets of short reads where at least one valid alignment is included in most of the reads; when the reads are high-quality; as well as when there is a small number of alignments reported by reads.

    The tool’s low memory footprint can be explained by the fact that it relies on a Burrows-Wheeler index to handle the genome, with the possibility of employing multiple processors at the same time in order to get enhanced alignment speed.

    It must be noted that, under normal circumstances, the rate at which it is capable of aligning 35-base pair reads to the human genome is 25 million reads per hour, with lcolorspace, gapped, and paired-end alignment modes being supported.

    Apart from that, you should know that SAM is among the file formats supported by Bowtie, which translates to the fact that the software utility can carry out tasks requiring collaborative efforts with the SAMtools consensus, indel callers, and SNP.

    It is worth mentioning that Bowtie is a piece of software users can interact with via command lines, so some technical skills are required.