• 分子模拟是一个迷人科学进军的深处的人类生物体,这可以产生重要的答案为我们的一些最基本的问题。 幸运的是,科学家们已经大大受益于该稳步增加,计算能力,因为越来越多的应用程序是专门为帮助他们解的生物的奥秘。 CompuCell3D只是一个这样的程序,可以采用通过训练有素的专业人员,以精确地模拟和模型细胞的行为。

    该科实用程序采用蜂窝兹的模式,具体的玻璃工-Graner-Hogeweg(GGH)的算法为模型并描述的行为单个或多个细胞组织、器官或者生物体。 这个格为基础的方法,确保模型是完全可以解决所产生的和模拟和细胞表示充分地扩展到实际的机制。

    创造一个模拟要求的用户定义的实际细胞,以及设计它们之间的相互作用。 这是执行通过设置新的特性,该项中的"模型编辑的"。 只是作为与任何程序的环境中,科学家可以调整的任何性质的仿真的要素,包括身体尺寸、体积和类型的细胞。

    对于任何可行的研究要发生的,还必须界定的幅度波动的程度和变化。 最初的构成的细胞也必须定义和用户可以进口这些物品从任何简单的数据文件。 之后所有这些步骤都已经完成,模拟是通过执行简单点击"运行"。

    然而,更多精通技术的用户会发现,应用程序的支持Python脚本和C++扩展的非常宝贵,因为它允许一个建立更为复杂和精确的生物模型。 在该模拟中,可以采取,也可以产生政策与投资框架文件从VTK产出。

    认为所有的事情,CompuCell3D是一个强有力的解决方案,任何人都活跃在该领域的生物造型,在该单元的水平。 该GGH算法是用于模型的单个或多个小区组织或生物精确的用户和高级用户还可以插入Python脚本生成的改善的分析。

  • आणविक मॉडलिंग एक मनोहर वैज्ञानिक चढ़ाई की गहराई में मानव जीव है, जो उपज कर सकते हैं महत्वपूर्ण जवाब में से कुछ के लिए हमारी सबसे मौलिक सवाल है । सौभाग्य से, वैज्ञानिकों से बहुत फायदा स्थिर वृद्धि की कम्प्यूटेशनल शक्ति, के रूप में अधिक से अधिक आवेदन कर रहे हैं मदद करने के लिए समर्पित उन्हें सुलझाना जैविक रहस्यों. CompuCell3D सिर्फ इस तरह के एक कार्यक्रम है कि नियोजित किया जा सकता द्वारा उच्च प्रशिक्षित पेशेवरों के लिए सही अनुकरण और मॉडल सेल व्यवहार ।

    वैज्ञानिक उपयोगिता को रोजगार सेलुलर Potts मॉडल, विशेष रूप से कांच का काम करनेवाला-Graner-Hogeweg (GGH) एल्गोरिदम करने के लिए आदर्श और व्यवहार का वर्णन के एकल या बहु-कोशिकाओं, ऊतकों, अंगों या जीवों. इस जाली आधारित दृष्टिकोण सुनिश्चित करता है मॉडल कर रहे हैं वास्तव में व्याख्या करने योग्य है और उत्पन्न सिमुलेशन और सेल निरूपण के लिए पर्याप्त रूप से बड़े पैमाने पर करने के लिए वास्तविक तंत्र है ।

    एक सिमुलेशन बनाने की आवश्यकता है कि उपयोगकर्ताओं को परिभाषित वास्तविक कोशिकाओं, के रूप में अच्छी तरह के रूप में डिजाइन के साथ उनकी बातचीत. इस स्थापना द्वारा किया जाता है नए गुणों के लिए प्रविष्टियों में "मॉडल संपादक" है. बस के रूप में किसी भी प्रोग्रामिंग वातावरण, वैज्ञानिकों को समायोजित कर सकते हैं किसी भी गुण के अनुकरण के तत्वों, सहित शारीरिक आयाम, मात्रा और सेल प्रकार के ।

    के लिए किसी भी व्यावहारिक अनुसंधान के लिए होते हैं, एक भी चाहिए को परिभाषित आयाम के उतार चढ़ाव और डिग्री की भिन्नता है । प्रारंभिक विन्यास की कोशिकाओं को भी परिभाषित किया जा सकता है और उपयोगकर्ताओं को आयात कर सकते हैं इन बाद के आइटम से किसी भी साधारण डेटा फ़ाइलें. इन सभी चरणों के बाद पूरा किया गया है, सिमुलेशन द्वारा किया जाता है, बस पर क्लिक करें "दौड़" बटन.

    हालांकि, अधिक तकनीक की समझ रखने वाले उपयोगकर्ताओं को मिल जाएगा आवेदन के समर्थन के लिए अजगर स्क्रिप्ट और C++ एक्सटेंशन अत्यधिक मूल्यवान, के रूप में यह अनुमति देता है एक का निर्माण करने के लिए और अधिक परिष्कृत और सही जैविक मॉडल है । अनुकरण के दौरान, स्क्रीनशॉट लिया जा सकता है और एक भी कर सकते हैं उत्पन्न PIF से फ़ाइलों को VTK outputs.

    सभी चीजों पर विचार, CompuCell3D है एक शक्तिशाली समाधान के लिए किसी को भी, के क्षेत्र में सक्रिय जैविक मॉडलिंग, के स्तर पर सेल है । के GGH एल्गोरिथ्म प्रयोग किया जाता है मॉडल करने के लिए एकल या बहु-सेल के ऊतकों या जीवों सही और उन्नत उपयोगकर्ताओं कर सकते हैं भी सम्मिलित अजगर स्क्रिप्ट उत्पन्न करने के लिए सुधार का विश्लेषण करती है ।

  • Molecular modeling is a fascinating scientific foray into the depths of the human organism, which can yield important answers to some of our most fundamental questions. Fortunately, scientists have benefited greatly from the steady increase of computational power, as more and more applications are dedicated to helping them unravel biological mysteries. CompuCell3D is just one such program that can be employed by highly trained professionals to accurately simulate and model cell behavior.

    The scientific utility employs cellular Potts models, specifically Glazier-Graner-Hogeweg (GGH) algorithms to model and describe the behavior of single or multi-cells tissues, organs or organisms. This lattice-based approach ensures models are exactly solvable and generated simulations and cell representations adequately scale up to the actual mechanisms.

    Creating a simulation requires that users define the actual cells, as well as design their interactions. This is performed by setting new properties to the entries in the “Model Editor”. Just as with any programming environment, scientists can adjust any properties of the simulation elements, including physical dimensions, volumes and cell types.

    For any viable research to occur, one must also define the amplitude of fluctuations and the degree of variation. The initial configuration of the cells must also be defined and users can import these latter items from any simple data files. After all these steps have been completed, simulation is performed by simply clicking on the “Run” button.

    However, more tech-savvy users will find the application's support for Python scripts and C++ extensions highly valuable, as it allows one to build more sophisticated and accurate biological models. During the simulation, screenshots can be taken and one can also generate PIF files from the VTK outputs.

    All things considered, CompuCell3D is a powerful solution for anyone active in the field of biological modeling, at the cell level. The GGH algorithm is used to model single or multi-cell tissues or organisms accurately and advanced users can also insert Python scripts to generate improved analyses.