• 紫红色是一个系统,用于有效地建设多种基因组对存在大规模进化的活动,如排和反向。 多个基因组的基准可以提供一个基础研究比较基因组学和研究进化的动态的一个全新的规模。 调整个基因组是一个从根本上不同的问题,比调整短的序列。

    紫红色已经发展的想法,一个基因组多的矫正器应仅需要适度的计算资源。 它采用了算法的技术,规模以及在数量顺序正在对准。 例如,一对鼠疫基因组,可以在一分钟内,而一组9个不同采用基因组,可以在几个小时。

  • चमकीला गुलाबी रंग के लिए एक प्रणाली है कुशलता से निर्माण कई जीनोम संरेखण की उपस्थिति में बड़े पैमाने पर विकास के रूप में की घटनाओं के पुनर्निर्माण और उलटा है । कई जीनोम संरेखण प्रदान कर सकते हैं के लिए एक आधार शोध में तुलनात्मक जीनोमिक्स और अध्ययन के विकासवादी गतिशीलता पर एक पूरे नए स्तर. संरेखित पूरे जीनोम एक मौलिक अलग समस्या aligning से कम दृश्यों.

    चमकीला गुलाबी रंग के साथ विकसित किया गया है कि विचार एक कई जीनोम aligner की आवश्यकता चाहिए केवल मामूली कम्प्यूटेशनल संसाधनों. यह रोजगार एल्गोरिथम तकनीक है कि अच्छी तरह पैमाने पर की राशि में अनुक्रम के साथ गठबंधन किया जा रहा है. उदाहरण के लिए, एक जोड़ी के Y. pestis जीनोम गठबंधन किया जा सकता है एक मिनट के अंतर्गत में, जबकि एक समूह के 9 अलग-अलग Enterobacterial जीनोम गठबंधन किया जा सकता है कुछ ही घंटों में.

  • Mauve is a system for efficiently constructing multiple genome alignments in the presence of large-scale evolutionary events such as rearrangement and inversion. Multiple genome alignment can provide a basis for research into comparative genomics and the study of evolutionary dynamics on a whole new scale. Aligning whole genomes is a fundamentally different problem than aligning short sequences.

    Mauve has been developed with the idea that a multiple genome aligner should require only modest computational resources. It employs algorithmic techniques that scale well in the amount of sequence being aligned. For example, a pair of Y. pestis genomes can be aligned in under a minute, while a group of 9 divergent Enterobacterial genomes can be aligned in a few hours.