• 分析蛋白质和肽涉及高度复杂的算法和统计方法。 幸运的是,指数增加的数字化工具还意味着生物学家、化学家,物理学家和所有其他感兴趣的专业人员在该领域的蛋白质组学现在已经有强有力的分析工具。

    PeptideShaker是这样的一个工具,有关该问题的不同方法。 有了它,用户可以查询九个平台,用于解释的蛋白质组学的结果:X!同时,MS-GF+、MS阿曼达,OMSSA,MyriMatch,彗星、潮汐、吉祥物,并mzIdentML的。 这会减少出错的风险并确保数据的妥善进行分析。

    然而,在任何的蛋白质处理、用户应该知道,该应用程序是资源高度密集型的,需要至少4GB。 此外,最新版本的Java应安装的(如果不能启动该程序,用户应该尝试的64位版)。

    这些技术规格左侧,应用程序的用户提供了一个全面的蛋白质分析环境。 有九个分析任务的支持,从概3D结构和质量控制的地块。 这些可从右边面板。

    PeptideShaker为用户提供了丰富的统计数据和描述数据,包括数量的肽、频谱相匹配的基因序列和本体论丰富的分析。 在适用的情况下,应用程序生成的数据丰富的图形在多种形式,包括酒吧的图表和泡泡图。 当情况允许,各个字符串中强调不同的颜色,允许快速之间的比较的数据集。

    所有的一切,PeptideShaker是一个伟大的工具,为科学家和其他专业人员参与研究蛋白质和肽。

  • विश्लेषण प्रोटीन और पेप्टाइड्स शामिल है, अत्यधिक जटिल एल्गोरिदम और सांख्यिकीय तरीकों में है. सौभाग्य से, घातीय वृद्धि में डिजिटल उपकरण है, यह भी मतलब है कि जीव, दवा की दुकानों, भौतिकविदों और अन्य सभी पेशेवरों के क्षेत्र में रुचि रखते प्रोटिओमिक्स अब शक्तिशाली विश्लेषण उपकरण अपने निपटान में है ।

    PeptideShaker है इस तरह के एक उपकरण के साथ चला जाता है कि समस्या के बारे में एक अलग विधि है । इसके साथ, उपयोगकर्ताओं को क्वेरी कर सकते हैं नौ प्लेटफार्मों की व्याख्या के लिए प्रोटिओमिक्स परिणाम: X!मिलकर, एमएस-प्रेमिका+, MS अमांडा, OMSSA, MyriMatch, धूमकेतु, ज्वार, शुभंकर, और mzIdentML. यह घटता है, त्रुटियों के जोखिम को सुनिश्चित करता है और डेटा है ठीक से विश्लेषण किया है ।

    हालांकि, इससे पहले किसी भी प्रोटीन संसाधित कर रहे हैं, उपयोगकर्ताओं को पता होना चाहिए कि आवेदन उच्च संसाधन गहन आवश्यकता है, और कम से कम 4 GB RAM की है । इसके अलावा, नवीनतम संस्करण के जावा स्थापित किया जाना चाहिए (अगर एक शुरू नहीं कर सकते हैं, इस कार्यक्रम के उपयोगकर्ताओं के लिए प्रयास करना चाहिए x64 बिट संस्करण) ।

    इन तकनीकी ऐनक बाईं ओर करने के लिए, आवेदन उपयोगकर्ताओं को प्रदान करता है के साथ एक व्यापक प्रोटीन विश्लेषण वातावरण । वहाँ नौ विश्लेषण कार्यों का समर्थन किया, से लेकर रूपरेखा के लिए 3 डी संरचनाओं और QC भूखंडों. इन से पहुँचा जा सकता है सही साइड पैनल है ।

    PeptideShaker उपयोगकर्ताओं को प्रदान करता है की एक धन के साथ सांख्यिकीय और वर्णनात्मक डेटा की संख्या सहित, पेप्टाइड्स, स्पेक्ट्रम मैचों दृश्यों और जीन आंटलजी संवर्धन का विश्लेषण करती है । जहां लागू हो, आवेदन उत्पन्न करता है, डेटा-अमीर ग्राफिक्स के रूप में कई रूपों सहित, बार चार्ट और बुलबुला भूखंडों. जब मामलों में यह अनुमति है, अलग-अलग तार कर रहे हैं पर प्रकाश डाला अलग अलग रंग में, अनुमति देने के लिए त्वरित तुलना के बीच डेटा सेट ।

    सब सब में, PeptideShaker है के लिए एक महान उपकरण वैज्ञानिकों और अन्य पेशेवरों को शामिल अध्ययन में प्रोटीन और पेप्टाइड्स.

  • Analyzing proteins and peptides involves highly complex algorithms and statistical methods. Fortunately, the exponential increase in digital tools has also meant that biologists, chemists, physicists and all other professionals interested in the field of Proteomics now have powerful analysis tools at their disposal.

    PeptideShaker is one such tool that goes about the problem in a different method. With it, users can query nine platforms for the interpretation of Proteomics results: X!Tandem, MS-GF+, MS Amanda, OMSSA, MyriMatch, Comet, Tide, Mascot, and mzIdentML. This diminishes the risk of errors and ensures data is properly analyzed.

    However, before any proteins are processed, users should know that the application is highly resource-intensive and requires at least 4 GB of RAM. Also, the latest version of Java should be installed (if one cannot launch the program, users should try the x64 bit version).

    These technical specs left to the side, the application provides users with a comprehensive protein analysis environment. There are nine analysis tasks supported, ranging from overviews to 3D structures and QC plots. These can be accessed from the right-side panel.

    PeptideShaker provides users with a wealth of statistical and descriptive data, including the number of peptides, spectrum matches sequences and gene ontology enrichment analyzes. Where applicable, the application generates data-rich graphics in multiple forms, including bar charts and bubble plots. When cases allow it, individual strings are highlighted in different colors, allowing for quick comparisons between data sets.

    All in all, PeptideShaker is a great tool for scientists and other professionals involved in studying proteins and peptides.