• ProfDistS是一个专门应用设计，以协助用户建造的大型系统发育的树木通过依靠配置文件的距离。 它可以用通过一个现代化的图形用户界面和能够显示系统发育的树木使用几个第三方公用事业。

    ProfDistS用户提供了一种系发生框架，它采用单独的RNA的次级结构为重建phylogenies的。 它是根据上的序列结构调整，并使用配置文件的邻居，加入，无论是人工或迭代和自动档的定义。 此外，应用程序还可以处理的蛋白质序列。

    任何东西之前，你应该确保树视图或NJplot是你的电脑上安装的。 同时，程序可以运行而这些公用事业，他们必须为了显示系统发育的树木。 你可以配置他们的路径，从应用程序的设置。

    ProfDistS可以变换的进口路线使用三种方法：概邻近的加入，RNA引导和距离计算的。 后加载的文件，可以选择最佳方法是从上下文的菜单。

    当尝试图谱树，该应用程序将打开它们的使用外部应用程序的定义。

    如果你需要帮助的任何方面，该软件的功能，可以访问的联机文档，通过帮助菜单。

    系统requirementsTreeView NJplot

  • ProfDistS के एक विशेष डिजाइन आवेदन करने के लिए उपयोगकर्ताओं की सहायता के निर्माण के साथ बड़े वंशावली पेड़ों पर भरोसा करके प्रोफ़ाइल की पहुंच जाएं । इसे इस्तेमाल किया जा सकता है के माध्यम से एक आधुनिक ग्राफिकल यूजर इंटरफेस और प्रदर्शित कर सकते हैं वंशावली पेड़ के एक जोड़े का उपयोग तृतीय-पक्ष उपयोगिताओं.

    ProfDistS उपयोगकर्ताओं को प्रदान करता है के साथ एक वंशावली ढांचे का उपयोग करता है जो अलग-अलग शाही सेना माध्यमिक संरचनाओं के पुनर्निर्माण के लिए phylogenies. यह है के आधार पर अनुक्रम संरचना संरेखण, और इसे का उपयोग करता है प्रोफ़ाइल की पहुंच पड़ोसी में शामिल होने के साथ, या तो मैनुअल या चलने और स्वत: प्रोफ़ाइल परिभाषा. इसके अलावा, आवेदन भी संभाल कर सकते हैं प्रोटीन दृश्यों.

    कुछ और करने से पहले, आप चाहिए सुनिश्चित करने के लिए या तो TreeView या NJplot अपने पीसी पर स्थापित है. जबकि कार्यक्रम के बिना चला सकते हैं इन उपयोगिताओं, वे आवश्यक हैं क्रम में प्रदर्शित करने के लिए वंशावली पेड़. आप कॉन्फ़िगर कर सकते हैं अपने पथ से आवेदन सेटिंग्स ।

    ProfDistS बदल सकते हैं आयातित संरेखण का उपयोग करने के तीन तरीके: प्रोफ़ाइल पड़ोसी में शामिल होने से, आरएनए bootstrapping और दूरी की गणना. फाइल लोड करने के बाद, आप का चयन कर सकते हैं पसंदीदा विधि संदर्भ मेनू से.

    कोशिश कर रहा है जब देखने के लिए वंशावली पेड़, आवेदन खुल जाएगा का उपयोग कर उन्हें बाहरी आवेदन आप सेटिंग्स में परिभाषित.

    अगर आप की जरूरत के साथ सहायता के किसी भी पहलू के सॉफ्टवेयर की कार्यक्षमता का उपयोग कर सकते हैं ऑनलाइन प्रलेखन के माध्यम से मदद करता है ।

    प्रणाली requirementsTreeView NJplot

  • ProfDistS is a specialized application designed to assist users with the construction of large phylogenetic trees by relying on profile distances. It can be used via a modern graphical user interface and can display phylogenetic trees using a couple of third-party utilities.

    ProfDistS provides users with a phylogenetic framework which uses individual RNA secondary structures for reconstructing phylogenies. It is based on sequence-structure alignments, and it uses Profile Neighbor Joining, with either manual or iterative and automatic profile definition. Additionally, the application can also handle protein sequences.

    Before anything else, you ought to make sure either TreeView or NJplot is installed on your PC. While the program can run without these utilities, they are required in order to display phylogenetic trees. You can configure their paths from the application’s settings.

    ProfDistS can transform the imported alignments using three methods: profile neighbor joining, RNA bootstrapping and distance calculation. After loading the file, you can select the preferred method from the context menu.

    When trying to view phylogenetic trees, the application will open them using the external application you have defined in the settings.

    If you need assistance with any aspect of the software’s functionality, you can access the online documentation via the Help menu.

    System requirementsTreeView NJplot